Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn8B1ARD8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms