Protein–RNA interactions for Protein: B1AQ75

Krt36, Keratin, type I cuticular Ha6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt36B1AQ75 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt36B1AQ75 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt36B1AQ75 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms