Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint6A7XUZ6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint6A7XUZ6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms