Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skint4A7TZF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint4A7TZF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms