Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll6A4Q9E8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll6A4Q9E8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms