Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CatsperbA2RTF1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms