Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm12A2AJ77 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms