Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramel3A2AHA7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramel3A2AHA7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms