Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8nlA2ABX0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp8nlA2ABX0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms