Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myom3A2ABU4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms