Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700023F06RikA2AB62 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700023F06RikA2AB62 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms