Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprfA2A8L5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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