Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb4A2A863 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb4A2A863 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms