Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpatch8A2A6A1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpatch8A2A6A1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gpatch8A2A6A1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms