Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms