Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms