Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv1A0A0B4J1G7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv1A0A0B4J1G7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv1A0A0B4J1G7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv1A0A0B4J1G7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv1A0A0B4J1G7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv1A0A0B4J1G7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv1A0A0B4J1G7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trbv1A0A0B4J1G7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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