Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn22Q9D7U6 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms