Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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