Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Snx17Q8BVL3 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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