Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NischQ80TM9 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NischQ80TM9 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NischQ80TM9 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NischQ80TM9 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NischQ80TM9 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NischQ80TM9 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms