Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms