Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trafd1Q3UDK1 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms