Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rps28P62858 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rps28P62858 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rps28P62858 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rps28P62858 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rps28P62858 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rps28P62858 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rps28P62858 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rps28P62858 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms