Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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