Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cux1P53564 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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