Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chd1P40201 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Chd1P40201 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms