Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RxraP28700 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms