Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PdgfraP26618 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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