Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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