Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms