Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Speer3W4VSP1 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms