Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Ccdc18Q640L5 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Ccdc18Q640L5 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Ccdc18Q640L5 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Ccdc18Q640L5 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Ccdc18Q640L5 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms