Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpusd2Q149F1 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms