Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SbdsP70122 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SbdsP70122 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms