Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Sh3bp1P55194 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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