Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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