Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprkP35822 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprkP35822 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms