Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxa2P31245 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms