Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms