Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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