Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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Ccl20O89093 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Ccl20O89093 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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