Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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H2-M1F7CXU4 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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