Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms