Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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