Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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Col5a3Q9JLI2 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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