Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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