Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Actn1Q7TPR4 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms