Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Ccdc18Q640L5 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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Ccdc18Q640L5 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Ccdc18Q640L5 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Ccdc18Q640L5 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Ccdc18Q640L5 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Ccdc18Q640L5 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Ccdc18Q640L5 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Ccdc18Q640L5 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Ccdc18Q640L5 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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