Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms